メルゼブルク司教ヴェルナー・フォン・ヴォルケンブルクは、おそらく当初の建築構想を完成させるため、交差部分の上に5つ目の塔の建設を開始しましたが、この塔は1230年に倒壊しました。ルドルフの支持者であったこの司教のおかげで、1080年にホーエンメルゼンでの戦いで負傷し、その傷が元で亡くなったルドルフ・フォン・ラインフェルデンは、メゼルブルク大聖堂に埋葬されることになった。しかし、追放された対立王 （1077年から1080年にかけて、ハインリヒ4世に対して）の死は、多くの同時代の人々から神の裁きと見なされていたにもかかわらず、ルドルフ・フォン・ラインフェルデンがメルゼブルク大聖堂に埋葬されたのは、この司教のおかげでした。
その後、特に1510年から1517年にかけて、司教ティロ・フォン・トロタのもとで、大聖堂は後期ゴシック様式に改築されました。バシリカ式身廊は、後期ゴシック様式のホール教会へと変貌を遂げました。そのため、老朽化した身廊は根本的に改築され、城に似せるために高い装飾的な切妻が取り付けられました。大聖堂の北側には、トロタ家の紋章を掲げた天使の砂岩のレリーフが今も残っています。翼廊の北端には、ティロ・フォン・トロタが城から自分の墓礼拝堂への入り口として、ティンパニにヤコブの天の梯子の夢、その下にトロタ家の紋章を描いた門を設置しました。ティロ・フォン・トロタは、司教礼拝堂を司教の墓所へと拡張し、回廊の東棟と南棟を改修し、南側にあるチャプターハウスを拡張したことでも知られています。
1490年頃、メルゼブルクに大聖堂説教者の職が創設されました。1545年、マルティン・ルターが大聖堂で説教を行いました。1561年に最後のカトリック司教ミヒャエル・ヘルディングが亡くなると、メルゼブルクでは宗教改革が完全に定着しました。大聖堂の敷地内に現存するキュリアの一部は、三十年戦争後にバロック様式で再建されました。これに伴い、現在も現存する大聖堂付属のギムナジウムの建物も新たに建設されました。1880年代、大聖堂の修復が推奨され、おそらくそれは実施されたと思われます。
第二次世界大戦中の空襲により、街自体だけでなく、近くにあるBUNA工場やロイナ工場も被害を受け、城の北翼と東翼、聖堂の聖歌隊席、聖歌隊席が損傷しました。2006年8月17日、文化大臣ヤン・ヘンドリック・オルベルツと司教アクセル・ノアックが出席した式典で、改装されたチャプターハウスが除幕されました。2010年にデッサウで開催された国際建築専門展示会を機に、大聖堂の自由は新たな活力を得ました。新しい訪問者・情報センターが設立され、ウィリー・ジッテ・ギャラリーがオープンし、ヨーロッパ・ロマネスク様式センターが設立されたのです。メルゼブルクの城および城の庭園とともに、この大聖堂は「ザクセン・アンハルトの夢の庭園」という総合作品の一部となっています。2011 年以来、レギーネ・ハルトコフが大聖堂の建築責任者を務めています。
王侯の墓所
メルゼブルク大聖堂には、1654 年以来、ヴェッティン家の次男ザクセン＝メルゼブルク家の家墓があり、大聖堂は宮廷教会として利用されていました。このいわゆる王侯の墓所は、バロック時代の葬送文化を象徴する重要な記念碑です。この墓所は、もともと 13 世紀から 16 世紀にかけて 3 つの部屋に分かれていました。豪華な門が王侯の墓所の入口を示しており、その上には公爵家の一族を描いた絵画が飾られています。1670 年、ザクセン＝メルゼブルク公クリスティアン 1 世は、大聖堂の東側に一族の安息の地を設けるよう命じました。王侯の墓所には37個の棺が安置されており、そのうち20個は子供用、10個は女性用、7個は男性用で、鉛、錫、木、あるいは鉛と錫の合金でできており、その紋章、碑文、装飾の一部が残っています。以下の公爵家のメンバーがここに埋葬されています。
- クリスティアン1世（1615年～1691年）、ザクセン＝メルゼブルク公
- クリスティアン2世（1653年～1694年）、ザクセン＝メルゼブルク公爵、クリスティアン1世の息子。
- エルムート・ドロテア・フォン・ザクセン＝ツァイツ（1661年～1720年）、クリスティアン2世の妻。
- ヨハン・ヴィルヘルム（1681年～1685年）、クリスティアン2世の息子。
- アウグスト・フリードリッヒ（1684年～1685年）、クリスティアン2世の息子。
- フィリップ・ルートヴィヒ（1686年～1688年）、クリスティアン2世の息子。
- フリードリヒ・エルドマン（1691年～1714年）、クリスティアン2世の息子。
- クリスティアーネ・エレオノーレ・ドロテア（1692年～1693年）、クリスティアン2世の娘。
- クリスティアン3世モーリッツ（1680年～1694年）、ザクセン＝メルゼブルク公爵、クリスティアン2世の息子。
- モーリッツ・ヴィルヘルム（1688年～1731年）、ザクセン＝メルゼブルク公爵、クリスティアン2世の息子。
- フリーデリケ・シャルロッテ・ウルリケ（1720年生まれ、1720年没）、モーリッツ・ヴィルヘルムの非嫡出の継娘。
- アウグスト（1655年～1715年）、ザクセン＝メルゼブルク＝ツェルビッグ公爵、クリスティアン1世の息子。
- ヘドヴィグ・エレオノーレ・フォン・メクレンブルク＝ギュストロー（1666年～1735年）、アウグストの妻
- クリスティアーネ・マグダレーネ（1687年～1689年）、アウグストの娘
- 死産（1689年）、アウグストの娘
- カロライン・アウグステ（1691年～1743年）、アウグストの娘
- ヘドヴィッヒ・エレオノーレ（*/† 1693）、アウグストの娘
- グスタフ・フリードリヒ（1694–1695）、アウグストの息子
- アウグスト（*/† 1696）、アウグストの息子
- フィリップ（1657–1690）、ザクセン＝メルゼブルク＝ラウシュシュテット公、クリスティアン1世の息子
- エレオノーレ・ソフィア・フォン・ザクセン＝ヴァイマル（1660年～1687年）、フィリップの最初の妻
- クリスティアナ・エルネスティナ（1685年～1689年）、フィリップの娘
- ヨハン・ヴィルヘルム（1687年～1687年）、フィリップの息子
- クリスティアン・ルートヴィヒ（1689年～1690年）、フィリップの息子
- ハインリヒ（1661年～1738年）、ザクセン＝メルゼブルク公、クリスティアン1世の息子
内装
メルゼブルク大聖堂は、その歴史の長さにもかかわらず、宗教改革や戦争による破壊といった歴史的な変化はあったものの、比較的豊かな内装が保たれています。
窓
中世のステンドグラスの一部が、西側入口の上、玄関ホールの中央にある3つの窓のグループの中央にある直径約60cmの4つのメダリオンに保存されています。これらは1260年頃にメルゼブルク・ナウムブルクの工房で制作されたものです。黒鉛を使用したステンドグラスは、1839年以来、何度か修復されています。マリアの受胎告知、キリストの誕生、三賢者の礼拝、そして磔刑が表現されています。第二次世界大戦で破壊された 1885/86 年製の歴史主義的な聖歌隊席のステンドグラスについては、チャールズ・クロデルが 1947 年から 1960 年にかけて、エアフルト大聖堂やハルバーシュタット大聖堂と同様に、中世の図像言語を現代風にアレンジして再現しました。クロデルは、フェルディナント・ミュラー（クヴェトリンブルク）のもとで、自らステンドグラス制作を行いました。窓の図像プログラムは、旧約聖書（左）と新約聖書（右）の出来事を、読み進める順に描いています。左側の窓には、預言者ヨナ ―アダムとイブの創造、魚に飲み込まれたヨナ、魚に吐き出されたヨナ、そして贖罪のヨナが葉の小屋にいる様子―が、右側の窓には、救いの出来事―キリストの誕生、十字架にかけられた者、復活した神の子、そして三位一体を表す「恵みの座」―が描かれています。
勝利の十字架と聖壇
もともと勝利の十字架群に属していた十字架が、交差部分にかけられています。オーク材で彫られたロマネスク様式の十字架は、3つの部分で構成されており、両腕は体の側面に差し込まれています。1240年頃に制作されたこの十字架には、中世の彩色がわずかに残っています。現在では、1954/55年に制作されたトウヒ材の支持十字架に取り付けられています。この十字架は、それに付随する勝利の十字架群（現存しない）とともに、舞台用ロトクルストの頂点を飾っていました。同様のレトナーと記念碑的な勝利の十字架群は、ハルバーシュタット大聖堂やヴェクセルブルクの聖堂教会などに見られます。レトナーからは、両側の聖歌隊席の柵が保存されています。北側の柵のニッチには、1500年頃に、ティロ司教の43人の前任者たちが、関連する碑文とともにセッコマレで描かれています。
洗礼盤
大聖堂の玄関には、1831年以来、赤砂岩製の単一の洗礼盤が置かれています。この石は、1188年に初めて文献に登場した、メルゼブルクのノイマルクト教会に由来しており、それよりかなり古いものとは考えられません。洗礼盤も、この時代に作られたものです。図像的な構成は、 (1) 円筒形の台座を支える 4 頭の横たわる獅子、 (2) 獅子の間にしゃがむ 4 つの楽園の川を象徴する寓話、
(3) 滑走部を構成する 12 の半円アーチ。その中には 12 人の預言者が立ち、それぞれの肩には使徒が 1 人ずつ座っています。預言者エレミヤの足元には、おそらくメルゼブルクの聖ペーター・ベネディクト会修道院の修道院長と思われる寄贈者がひざまずいています。
南側横廊、王侯の墓所入口の前には、もう一つの洗礼盤があります。杯の形をした砂岩製のこの洗礼盤は、1665年のものと推定されています。六角形の杯の各面には、3つから4つの彫刻が施された紋章が、合計21個刻まれており、銘文に記されている寄贈者、ザクセン＝メルゼブルク公クリスティアン1世の威厳を表しています。
祭壇
メルゼブルク大聖堂には、いくつかの祭壇が保存されています。まず、13 世紀前半に制作された、ニーダーザクセンまたは中部ドイツ産の可動式祭壇が挙げられます。この祭壇は、オーク材で作られた長方形の木製の本体で、上部に遺物を収めるための六角形のくぼみがあります。側面は銀板で覆われており、長辺にはそれぞれ5つ、短辺には3つ、角柱には1つずつ、レリーフが保存されています。正面中央には十字架上のキリスト、その両脇には使徒ペテロとパウロ、その左側にはキリストの誕生、その右側には受胎告知が描かれています。左側の短辺には、聖人の斬首、正面と同じ構図の聖パウロ、そして、身元不明の聖人と横断幕が表現されています。背面には、正面とは別の別の誕生の場面、その横にはおそらく聖人（断片的にしか残っていません）が表現されています。左側の狭い側面にはレリーフは残っていませんが、角柱には 4 人の福音書記者たちが描かれています（これも断片的にしか残っていません）。
さらに、聖母マリアの彫刻が施された小さな翼の祭壇画（1500年頃、メルゼブルク工房？）、諸聖人の祭壇画（1505年頃、オランダ）、聖母マリアの翼の祭壇画（1517年頃、ビザンチン・マドンナの巨匠）、グレゴリオミサの翼の祭壇画 （1517年頃、ビザンチン・マドンナの巨匠）、ホルトゥス・コンクルスス（Hortus Conclusus）を描いた小さな翼のある祭壇画（1530年頃、中部ドイツ）、天使の栄光に包まれたマドンナを描いた三連祭壇画（1530年頃、中部ドイツ）、ハインリッヒ祭壇（1536/37年 – ルーカス・クラナッハ（父）とその工房）、聖ゲオルギオスのミサを描いた小さな祭壇画 （1516年 – ビザンチン・マドンナの巨匠）、聖カタリナの神秘的な結婚を描いた翼のある祭壇画（1518年、ヴィッテンベルク – クラーナッハ工房の巨匠、メルゼブルクのマリアとカタリナの祭壇の巨匠）、そしてバロック様式の主祭壇（1668年 – 作家不詳）があります。
墓碑と墓
教会と回廊には、司教、大聖堂参事会員、貴族たちの墓碑や墓碑が置かれており、その多くは芸術的に優れたものです。
司教ティートマル（1018年没）の墓碑は、シンプルな砂岩の石板で、13世紀のものと推定されています。1883年には、碑文はわずかな部分しか読めなくなりましたが、その内容は写し書きとして残っています。ティートマルの墓石の隣には、メルゼブルクの初代司教たちの墓を示すシンプルな石板があります。当初は聖ヨハネス教会に埋葬されていましたが、最初の聖堂が建てられた後、この場所に移葬されました。最も重要な芸術作品は、1080年10月15日に亡くなったルドルフ・フォン・シュヴァーベンの墓石で、聖堂の聖歌隊席にあります。これは、ドイツ中世最古の肖像墓とされており、特に青銅鋳造の技術的な完成度の高さが際立っています。
司教ティロ・フォン・トロタ（1514年没）の墓碑銘と墓は、北翼廊にあり、真鍮でできています。墓碑の蓋板は、おそらく1470/80年頃、つまりティロの死の前に、ヘルマン・フィッシャー・エルダーによって制作されたものと思われます。墓碑と側壁はフィッシャーの工房によるもので、1514年頃に制作されたものと推定されています。大聖堂の玄関ホールにある司教ジギスムント・フォン・リンデナウ（1544年没）の墓碑は、高さ2.46メートル、幅1.29メートルの鋳造ブロンズ板で、彫刻と彫金加工が施されています。目に見える署名「HF」と師匠の印は、ニュルンベルクの彫刻家ハンス・ヴィッシャーの作品であることを示しています。
さらに、13 世紀半ばに制作された、ナウムブルクの巨匠またはその工房によるものとされる、騎士ヘルマン・フォン・ハーゲン（Hayn/Hahn）の墓碑、マクデブルク大司教フリードリヒ 2 世フォン・ホイム（1362 年没）の墓碑、 ビショップ・ヴィンツェンツ・フォン・シュライニッツ（1535年没）の墓碑、ビショップ・アドルフ・フォン・アンハルト（1526年没）の墓碑、ビショップ・ジギスムント・フォン・リンデナウ（1544年没）の墓碑と墓礼拝堂の旧柵があります。回廊と十字架の庭には、大聖堂の聖職者たちのバロック様式の墓碑が数多くあります。それに関連するレンガ造りの墓室は、一部は内部が漆喰で塗られ、色も塗られていますが、発掘調査によってその存在が確認されています。レンガ造りの墓室に加え、2004年の発掘調査では、木製の棺に埋葬された数多くの土葬も確認されました。
オルガン
バロック様式のファサード（1700年頃）の後ろにあるラデガスト・オルガン（1855/66年）は、バックポジティブとシュライアーヴェルクを備えています。
13世紀の終わりには、オルガン（「ad organa」）のために多額の遺産が遺贈されたことから、オルガンが存在していたことが確認できます。当時、この種のオルガンは、北壁に設置された、複数のマニュアルを備えたツバメの巣型オルガンであったと思われます。
メインオルガン
1665年から1666年にかけて、無名のオルガン製造者が新しい楽器を製作し、1674年にクリストフ・ユンゲがそれを拡張しました。1693年から1705年にかけて、ザカリアス・タイスナーが大幅な拡張改造を行い、古い部品を使用して現在の豪華なプロスペクトを作り上げました。タイスナーの作品は41のレジスタで構成されていましたが、品質は満足のいくものではなく、未完成のまま残されました。ヨハン・フリードリッヒ・ヴェンダー（1714年から1717年）の時代に、ようやくこのオルガンは完成しました。ヴェンダーは、新しい風箱と 6 つの新しいベローズを製作しました。彼はまず 50 のレジスタに拡張し、第 2 段階の工事では、追加の胸部楽器を 66 のレジスタに拡張しました。メルゼブルクのオルガン製造者ヨハン・ゴットフリート・クルグは、1780 年に、オルガンの最上部と背面にスウェルボックスを取り付けて、上部楽器を補完しました。この箱は、演奏台からワイヤーで扉を開閉することができ、その中に「エコー」という音域を設置しました。バックポジティブには、下層ギャラリーから演奏できる、1つのマニュアルを備えた小さな2番目の演奏台が設置されました。しかし、このオルガンは修理が必要になることが多かったため、1843年から1847年にかけて、さまざまな改造計画が立案されました。
この大聖堂には、ドイツで最大かつ最も重要なロマン派オルガンのひとつが現在設置されています。このオルガンは、オルガン製造者フリードリッヒ・ラーデガストによって 2 段階（1853 年から 1855 年、および 1866 年）に分けて製作されました。4 つのマニュアルとペダルに 81 のレジスタが配され、合計 5687 本のパイプが備わっています。ゲウサ村の教会にある小さなラデガスト製のオルガンの質の高さを評価した、当時のメルゼブルク大聖堂のオルガニストでありオルガン検査官でもあったデヴィッド・ヘルマン・エンゲルは、若きラデガストに大聖堂のオルガンの製作を依頼しました。当初、彼は既存のオルガンの修理を4500ターラーで請け負う予定でしたが、1853年の夏に始まったこのプロジェクトは、古いプロスペクトの後ろに6258ターラーをかけて新しいオルガンを建設するという結果に終わりました。ラデガストは当初、旧オルガンの26のレジスタを使用しましたが、1866年までに、シャルミーとスチールプレーを除くすべてのレジスタを独自のレジスタに交換しました。ラデガストがブリュストワークに組み込んだスウェルは、当時としては斬新なものでした。この演奏補助装置は、19世紀後半になってようやくドイツのオルガン製造で広く普及したからです。もう一つの特徴は、小さなオルガンギャラリーの下、中央身廊の幅全体に広がる音楽家用ギャラリーの上に設置された、独立した小さな演奏台です。この手動鍵盤では、バックポジティブのすべてのレジスタを、ペダルでは 16 フィートと 8 フィートの 2 つのペダルレジスタを演奏することができます。この追加の演奏台は、その上のギャラリーにある 4 段鍵盤の演奏台では十分なスペースが確保できないアンサンブルとの共演を可能にしています。
フランツ・リストは、1855年の夏にオルガンの建設現場を何度か視察し、オルガンの奉献式のために、新しい大規模な作品、幻想曲とフーガ、B-A-C-Hを作曲したいと考えていました。しかし、彼はこの作品を間に合わせることができず、代わりに、1852 年からオルガン、ペダル付きピアノ、または 3 または 4 手のピアノ用に印刷版が発行されていた「Ad nos, ad salutarem undam」の幻想曲とフーガを演奏することを提案しました。彼の弟子であるアレクサンダー・ヴィンターベルガーは、1855年9月26日に、リストの立ち会いのもと、新しいオルガンの奉献式で、この作品のオルガン版を初めて演奏しました。1856年には、再びウィンターベルガーによって、リストがオルガンの奉献式のために作曲した「B-A-C-Hによる幻想曲とフーガ」が初演されました。1857年には、ユリウス・ロイブケが、彼のオルガンソナタ「詩篇94」をここで初演しました。1876年、メルゼブルクのオルガン製造会社ゲルハルト社がバーカー式機械を設置。カール・シュトラウベは、メルゼブルク大聖堂のオルガンを使用して、レーガーのオルガンソナタ第2番ニ短調作品60を初演した。
1962 年から、メルゼブルクのオルガン製造会社 ゲルハルト・キューンによって、最初の修復、再配置、IV マニュアルのシュウェル（スウェル）の撤去が行われた後、2001 年から 2004 年にかけて、Eule、Scheffler、Wegscheider の各社による大規模な改修と修復が行われました。これらのオルガン製造会社は、1960年代に行われた、ラデガストの全体構想にそぐわない配置の変更を元に戻し、オルガンを1866年の状態に戻しました。その配置は以下の通りです。
